ولد الدكتور حسن هويدي في مدينة دير الزور بسورية عام 1925م، ونشأ في كنف أسرة مسلمة مشهورة بالإباء والكرم. وكان والده معروفًا في دير الزور، ملتزمًا بالدين والمساجد، وله أبلغ الأثر رحمه الله في مسيرة الدكتور.