أظهر تصنيف Transparent Ranking للاستشهادات المرجعية الواردة بملفات الباحثين البارزين من خلال Google Scholar نسخة يناير للعام الحالي 2025، حصول جامعة الزقازيق على المركز الثاني على مستوى الجامعات المصرية من بين 53 جامعة مصرية مدرجة بالتصنيف، والمركز الـ 2157 عالميًا من بين 30 ألف جامعة مدرجة بالتصنيف، وفقًا للتصنيف الشفاف للجامعات الصادر عن Google Scholar.