تحدث غالبية أنواع عدوى المسالك البولية بسبب البكتيريا التي تدخل مجرى البول، ومن ثم المثانة. وقد تنتشر إلى الكليتين. وفي غالبية الأحيان، يستطيع الجسم التخلص من هذه البكتيريا، لكن في حالات معينة قد تسبب خطر الإصابة بالتهابات المسالك البولية.